Akademik Bilgiler



EMRE ERDEN ÇAKMAKLI
ÖĞRETİM GÖREVLİSİ
Fen Fakültesi
Biyokimya Bölümü
Biyokimya Ana Bilim Dalı
Contact Information- E-posta: emrerden@gmail.com
- E-posta: emre.erden@ege.edu.tr
Academic Degree Information- Lisans: Ege Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyokimya Bölümü , Türkiye , 2006
- Yüksek Lisans: Ege Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyokimya Bölümü , Türkiye , 2009
- Doktora: Ege Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyokimya Bölümü , Türkiye , 2015

Administrative / Academic Duties (1 entries)- Öğretim Görevlisi, 2014-
Other Professional Activities (9 entries)- Metabolizma Mühendisliği Lisansüstü Yaz okulu 19-25 Haziran 2011, Bodrum/TÜRKİYE (Technical Staff), 2011-In Progress
- 14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı, BİYOMUT 2009, 20-24 Mayıs 2009, İzmir/Türkiye, 2009-In Progress
- The 7th Workshop on Biosensors and Bioanalytical Techniques in Environmental and Clinical Analysis, 10-14 Eylül 2006, - Kuşadası/TÜRKİYE,
- International Enzyme Engineering Symposium, IEES’08, 01-05 Ekim 2008, -Kuşadası/TÜRKİYE (Technical Staff),
- Metabolizmanın Regülasyonu ve Metabolik Bozukluklar Lisansüstü Yaz Okulu, 29 Haziran-06 Temmuz 2008, TRABZON,
- 3. Ulusal HPLC ve Mass Spektrometri Çalıştayı ve Sempozyumu (Uluslararası katılımlı), 20-23 Mayıs 2008, ANKARA,
- Biyoremediasyon; Temel Esasları ve Uygulamaları, 10-11 Aralık 2007, (EBİLTEM) İZMİR,
- 13. Uygulamalı Flow Sitometri Eğitimi, İstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp araştırma Enstitüsü (DETAE), 11-15 Haziran 2007, İSTANBUL,
- Kanser Biyokimyası Sempozyumu, Ege Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Topluluğu (EBİLTET) 2 Mart 2007, İZMİR,
Research Interests- Biyokimya (4050501)
- Biyoteknoloji (6140207)
Indexed Journal Publications (5 entries)- 2012, Pazarlioglu NK, Erden E, Ucar MC, Akkaya A, Sariisik AM, Batch production of Pyranose 2-oxidase from Trametes versicolor (ATCC 11235) in medium with a lignocellulosic substrate and enzymatic bleaching of cotton fabrics, World J Microbiol Biotechnol., 28(4):1523-3.
- 2011, Emre ERDEN, Yasin KAYMAZ, Nurdan KASIKARA PAZARLIOGLU, Biosorption Kinetics of A Direct Azo Dye Sirius Blue K-CFN by Trametes Versicolor, Electronic Journal of Biotechnology, vol.14-issue2-fulltext-8.
- 2010, Uğur Ş.S., Sarıışık M., Aktaş A.H., Uçar M.Ç., Erden E., Modifying of cotton fabric with Nano-ZnO multilayer films by layer-by-layer deposition method, Nanoscale Research Letter, Vol: 5, p 1204-1210.
- 2009, Emre ERDEN, M. Cigdem UCAR, Tekin GEZER, Nurdan KASIKARA PAZARLIOGLU, Screening for ligninolytic enzymes from autochthonous fungi and applications for decolorization of remazole marine blue, Brazilian Journal of Microbiology, Vol: 40, p 346-353.
- 2008, Emre ERDEN, M. Çigdem UÇAR, Yasin KAYMAZ, Nurdan PAZARLIOĞLU: New and Different Lignocellulosic Materials from Turkey for Laccase and Manganese Peroxidase Production by Trametes versicolor, Engineering in Life Sciences, Vol: 9, p1-6.

International Conference Proceedings (20 entries)- Gizem Ceylan TÜRKOĞLU, Ayşe Merih SARIIŞIK, Gökhan ERKAN, Emre ERDEN, Nurdan PAZARLIOĞLU, Selda ÖZTUNA, Oya KONTART, Formation inclusion complexes of β-Cyclodextrin-Tymol and the bacterial properties of textile finishing. Achen Dresden 7th International Textile Conference 2013, 28-29 November, Aachen/GERMANY (Best Poster Award)
- Nurdan PAZARLIOĞLU, Gözde ODABAŞ, Tuncay AVCI, Emre ERDEN, Biochemical agents in detergents: Enzymes. International Cleaning & Personel Care Products and Production Technologies Symposium and Exhibition 2013, 7-9 November, Çeşme-İzmir/TÜRKİYE (Oral presentation)
- Gizem Ceylan TÜRKOĞLU, Ayşe Merih SARIIŞIK, Gökhan ERKAN, Emre ERDEN, Nurdan PAZARLIOĞLU, Selda ÖZTUNA, Oya KONTART, Designing an antimicrobial textile product based on carvacrol β-Cyclodextrin complex. International Cleaning & Personel Care Products and Production Technologies Symposium and Exhibition 2013, 7-9 November, Çeşme-İzmir/TÜRKİYE
- Emre ERDEN, Yunus ENSARİ, Nurdan PAZARLIOGLU, Metabolic approaches for the production of polyhydroxyalkanoates, The International Congress of Bioinfomatics and Biomics (ICBB-2011), 18-22 May 2011, İzmir/TÜRKİYE.
- Yunus ENSARİ, Emre ERDEN, Nurdan PAZARLIOGLU, PHA production by different recombinant Escherichia coli strains, The International Congress of Bioinfomatics and Biomics (ICBB-2011), 18-22 May 2011, İzmir/TÜRKİYE.
- Aslı GÖÇENOĞLU, A. Mehmed AHMED, M. Çiğdem UÇAR, Emre ERDEN, Nurdan PAZARLIOGLU, Optimization of cinnabarinic acid from Pycnoporus cinnabarinus and production in stirred tank reactor, 5th International Bioengineering Congress, 16-19 June 2010, İzmir/TURKİYE (poster birinciliği)
- Emre ERDEN, M. Çiğdem UÇAR, Selin ÖZKIYICI, Ümit KARACA, Nurdan PAZARLIOGLU, Antibiotic Immobilization on PHA Nanofiber, 4th International Student Conference on Advanced Science and Technology ICAST 2010, 25-26 May 2010, İzmir/TÜRKİYE
- Emre ERDEN, M. Çiğdem UÇAR, Nurdan PAZARLIOGLU, Biotechnological Approaches to the Production and Medical Usage of Bacterial Biopolymers, 15th International Biomedical Science and Technology Symposium BIOMED 2009, 16-19 August 2009, Güzelyurt/KIBRIS
- Emre ERDEN, Nurdan PAZARLIOGLU, Biobleaching of Cotton Cabrics by Microbiological Processes, AUTEX 2009 World Textile Conference, 26-28 May 2009, Çeşme/ TÜRKİYE
- M. Çiğdem UÇAR, Hatice ARDAĞ AKDOĞAN, Emre ERDEN, Nurdan PAZARLIOĞLU, Chromatographic Analysis of Phenol Biodegradation by Pycnoporus cinnabarinus, 6th Aegean Analytical Chemistry Days, 09-12 September 2008, Denizli/TÜRKİYE
- Nurdan PAZARLIOĞLU, Alper AKKAYA, Emre ERDEN, Çiğdem UCAR, Pyranose 2-Oxidase Production by Trametes versicolor using Clover Straw in Stirred Tank Reactor, International Enzyme Engineering Symposium IEES’08, 01-05 September 2008, -Kuşadası/TÜRKİYE
- Nurdan PAZARLIOĞLU, Merih SARIIŞIK, Alper AKKAYA, Emre ERDEN, M. Çiğdem UÇAR, Biobleaching of Cotton Fabrics by Pyranose Oxidase from Trametes versicolor, International Enzyme Engineering Symposium IEES’08, 01-05 September 2008, -Kuşadası/TÜRKİYE
- M. Çiğdem UÇAR, Hatice ARDAĞ AKDOĞAN, Emre ERDEN, Aslı GÖÇENOĞLU, Nurdan PAZARLIOĞLU, The Role of Laccase Produced by Pycnoporus cinnabarinus on Phenol Biodegradation, International Enzyme Engineering Symposium IEES’08, 01-05 September 2008, -Kuşadası/TÜRKİYE
- Aslı GÖÇENOĞLU, M. Çiğdem UÇAR, Emre ERDEN, Funda ÖZMEN, Orhan R. KARANİ, Mehmet KUZUCU, Nurdan PAZARLIOĞLU, Cinnabarinic acid and laccase production by Pycnoporus cinnabarinus, International Enzyme Engineering Symposium IEES’08, 01-05 September 2008, -Kuşadası/TÜRKİYE
- Alper AKKAYA, Dilek ODACI, Çiğdem UCAR, Emre ERDEN, Nurdan PAZARLIOGLU, Suna TIMUR, Azmi TELEFONCU, Pyranose Oxidase (p2o) Produced From Agricultural Residues by T. versicolor and Use in Biosensing Systems, International Enzyme Engineering Symposium IEES’08, 01-05 September 2008, -Kuşadası/TÜRKİYE
- Nurdan PAZARLIOĞLU, Alper AKKAYA, Emre ERDEN, M. Çiğdem UÇAR, Production of Pyranose 2-Oxidase from Trametes versicolor by Using Agricultural Residues, Europen Bioperspectives, 30 Mayıs-1 Haziran 2007, Cologne/ GERMANY
- Emre ERDEN, Yasin KAYMAZ, Nurdan PAZARLIOĞLU, Biosorption of Sirius Blue by Trametes versicolor Biomass, 15th European Biomass Conference&Exhibition, 7-11 Mayıs 2007, Berlin/ GERMANY
- Emre ERDEN, M. Çiğdem UÇAR, Nurdan PAZARLIOĞLU, Manganese Peroxidase Production by Using Several Agricultural Residues in Submerged Fermentation by Trametes versicolor, 15th European Biomass Conference&Exhibition, 7-11 May 2007, Berlin/ GERMANY
- M. Çiğdem UÇAR, Emre ERDEN, Nurdan PAZARLIOĞLU, Conversion of Agricultural Residues into Value-Added Products by Trametes versicolor, 15th European Biomass Conference&Exhibition, 7-11 May 2007, Berlin/GERMANY
- Nurdan PAZARLIOĞLU, Alper AKKAYA, Emre ERDEN, M. Çiğdem UÇAR “Production of pyranose-2-oxidase from Trametes versicolor by agricultural residues” GeT Univation German-Turkish University Conference and Project Marketplace 26-28 February 2007 Braunschweig, GERMANY

National Conference Proceedings (10 entries)- Emre ERDEN, M. Çiğdem UÇAR, Nurdan PAZARLIOGLU, Nitrilase Immobilization on Biodegradable Nanofiber Based Poly-3-Hydroxybutyrate (PHB) and Polyhydroxybutyrate-co-3-hydroxyvalerate (PHBV), 6th Nanoscience and Nanotechnology conference NANOTR-VI, 15-18 June 2010, Çeşme/TÜRKİYE (Uluslar arası katılımlı)
- E. ERDEN, M. Ç. UÇAR, A. AKKAYA, N. PAZARLIOGLU, Biyobozunur ve Biyouyumlu Bakteriyel Polimerler Üzerine Çeşitli Antibiyotiklerin İmmobilizasyonu ve Antibakteriyel Etkinliklerinin Araştırılması, 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 14-16 Aralık 2009, ANTALYA (sözlü bildiri)
- A.GÖÇENOĞLU, M.Ç. UÇAR, E. ERDEN, P. AKÇAKOCA KUMBASAR, M. SARIIŞIK, N. PAZARLIOĞLU, “Pycnoporus cinnabarinus’tan Üretilen Sinnabarinik Asidin İzolasyonu, Yün Boyama Özelliği ve Antibakteriyal Etkisinin Araştırılması, 16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 14-16 Aralık 2009, ANTALYA (sözlü bildiri)
- M. Çiğdem UÇAR, Hatice ARDAĞ AKDOĞAN, Emre ERDEN, Aslı GÖÇENOĞLU, Nurdan PAZARLIOĞLU, Pycnoporus cinnabarinus Tarafından Fenolün Biyodegradasyonu, 3. Ulusal HPLC ve Mass Spektrometri Çalıştayı ve Sempozyumu (Uluslar arası katılımlı), 20-23 Mayıs 2008, ANKARA
- Emre ERDEN, M. Çiğdem UÇAR, Tekin GEZER, Nurdan PAZARLIOĞLU, Endüstriyel Uygulamalarda Geniş Kullanım Alanına Sahip Ligninolitik Enzimler İçin Farklı Fungus Kaynaklarının Araştırılması, 15. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 28-31 Ekim 2007, ANTALYA (sözlü bildiri)
- Nergiz GÜRBÜZ, M. Çiğdem UÇAR, Emre ERDEN, Nurdan PAZARLIOĞLU, Katı Hal Fermentayonu ile Abortiporus biennis Kullanılarak Tarımsal Atıklardan Mangan Peroksidaz (MnP) Üretimi, 15. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 28-31 Ekim 2007, ANTALYA
- M. Çiğdem UÇAR, Emre ERDEN, Nurdan PAZARLIOĞLU. Tekstil Boyar Maddelerin Dekolorizasyonunda Farklı Fungus Tiplerinin Uygulanabilirliği, 15. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 28-31 Ekim 2007, ANTALYA
- B.Tuba FINDIK, M. Ç. UÇAR, E. ERDEN, N. PAZARLIOĞLU, Trametes versicolor Kullanılarak Zirai Atıklarda Katı Hal Fermentasyonu ile Lignolitik Enzim Üretiminin İncelenmesi, 15. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 28-31 Ekim 2007, ANTALYA
- İmre ÖZEN, Emre ERDEN, M. Çiğdem UÇAR Nurdan PAZARLIOĞLU, Pleurotus ostreatus Tarafından Tarımsal Atıklar Kullanılarak Mangan peroksidaz Üretiminin İncelenmesi, 15. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 28-31 Ekim 2007, ANTALYA
- Adem Mehmed AHMED, Emre ERDEN, M. Çiğdem UÇAR, Nurdan PAZARLIOĞLU, Pleurotus ostreatus’ tarafından katı hal fermentasyonu ile lakkaz üretimi, 15. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 28-31 Ekim 2007, ANTALYA

Books (1 entries)- Biotechnology of Microbial Enzymes, N. Kasikara Pazarlioglu and E. Erden, “Applications of Microbial Enzymes in the Textile Industry” (Ed: Vijai Kumar Gupta, Nova Science Publishers, 2011) ISBN:978-1-62100-131-7.

Memberships of Professional Associations (2 entries)- European Federation of Biotechnology
- Türk Biyoteknoloji Derneği
Granted Scholarships (5 entries)- , Projede Burslu Öğrenci (TÜBİTAK Projesi, Proje No:104M420), 2006-2008 (18 ay)
- , Projede Burslu Öğrenci (TÜBİTAK Projesi, Proje No:108M219), 2008-2009 (12 ay)
- , Projede Öğrenci (TÜBİTAK Projesi, Proje No:108T936), 2009-2011 (18 ay)
- , Projede Burslu Öğrenci (SAN-TEZ Projesi, Proje No: 00657.STZ.2010-2), 2010-2012 (18 ay)
- , Projede Burslu Öğrenci (TÜBİTAK Projesi, Proje No: 113Z813), 2014-2016 (24 ay)
Granted Prizes (2 entries)- 2013, Formation inclusion complexes of β-Cyclodextrin-Tymol and the bacterial properties of textile finishing. Achen Dresden 7th International Textile Conference 2013, 28-29 November, Aachen/GERMANY (Best Poster Award)
- 2010, Optimization of cinnabarinic acid from Pycnoporus cinnabarinus and production in stirred tank reactor, 5th International Bioengineering Congress, 16-19 June 2010, İzmir/TURKİYE (best poster award)
Student's Completed Thesis (2 entries)- Doktora, 2010, Ege Üniversitesi, BAP no: 2010 Fen 056, “Pseudomonas sp.’den Karıştırmalı Tank Reaktöründe Polihidroksialkanoatların Üretimin Optimizasyonu, Kinetik Modellendirilmesi, İzolasyonu, Karakterizasyonu ve Biyomateryal Olarak Kullanım Olanak...
- Yüksek Lisans, 2009, Ege Üniversitesi, BAP no: 2008 Fen 015, "“Pamuklu Dokuma Kumaşların Mikrobiyal İşlemlerle Ağartılması” Araştırmacı, Yüksek Lisans Tezi