Akademik Bilgiler



KEMAL S KORKMAZ
PROFESÖR
Mühendislik Fakültesi
Biyomühendislik Bölümü
Biyomühendislik Anabilim Dalı
İletişim Bilgileri- E-posta: ks_korkmaz@yahoo.com
Eğitim Bilgileri- Lisans: Orta Dogu Teknik Universitesi, Fen Fak, Biyolojik Bilimler, Türkiye, 1988
- Yüksek Lisans: Dokuz Eylul Univ. Tip Fak., Tibbi Biyoloji AB. Dali, Türkiye, 1992
- Doktora: Dokuz Eylul Univ. Tip Fak., Tibbi Biyoloji AB. Dali, Türkiye, 1997
- Doçentlik: Ege Univ. Muh Fak. Biyomuhendislik Bolumu, Türkiye, 2004
- Profesörlük: Ege Üniversitesi, Türkiye , 2012

İdari ve Akademik Görevleri (3 adet)- Müh. Fak. BAP komisyon üyeliği, 2006-
- Sidney Kimmel Cancer Center (doktora sonrası araştırmalar), 2002-2004
- Oslo Üniversitesi, Biyoteknoloji Merkezi (Doktora Sonrası araştırmalar), 1998-2002
Mesleki Faaliyetleri (4 adet)- TUBITAK-BIDEB yurtdışı doktora programı hakem, 2009-2010
- TUBITAK-TBAG panelist, 2008-Devam Ediyor
- TUBITAK-SBAG panelist, 2006-Devam Ediyor
- TUBITAK-TOVAG panelist, 2006
Uzmanlık Alanları- Tıbbi Biyoloji (1010101)
- Biyoloji Eğitimi (2240800)
- Moleküler Biyoloji (4010200)
- Hücre Biyolojisi (4010201)
- Biyomühendislik (6120000)
İndekslerce Taranan Dergilerdeki Yayınları (30 adet)- Early life stress-induced histone acetylations correlate with activation of the synaptic plasticity genes Arc and Egr1 in the mouse hippocampus. Xie L, Korkmaz KS, Braun K, Bock J. J Neurochem. 2013 Feb 16. doi: 10.1111/jnc.12210. [Epub ahead of print]
- Varisli L., Korkmaz C., Mohammed S. H., Bogurcu N., Debelec-Butuner B., Erbaykent-Tepedelen B., Korkmaz K.S., Androgen regulated HN1 leads proteosomal degradation of androgen receptor (AR) and negatively influences AR mediated transactivation in prostate cells. Molecular and Cellular Endocrinology 350 (2012) 107 - 117
- Bilge Debelec-Butuner, Cansu Alapinar, Lokman Varisli, Burcu Erbaykent-Tepedelen, Syed Muhammad Hamid, Ceren Gonen-Korkmaz, Kemal Sami Korkmaz. Inflammation-mediated abrogation of androgen signaling in LNCaP cells: an in vitro model of inflammation in prostate cell lines. Molecular Carcinogenesis. 2012 Aug 21. doi: 10.1002/mc.21948.
- Erbaykent-Tepedelen B., Özmen B., Varisli L., Gonen-Korkmaz C., Debelec-Butuner B., Syed M.H., Yilmazer-Cakmak O., Korkmaz K.S., NKX3.1 contributes to S phase entry and regulates DNA damage response (DDR) in prostate cancer cell lines. Biochem Biophys Res Commun. 2011 Sep 12; 414 (1):123-128
- Bogurcu N., Sevimli-Gur C., Ozmen B., Bedir E., Korkmaz K.S., ALCAPs induce mitochondrial apoptosis and activate DNA damage response by generating ROS and inhibiting topoisomerase I enzyme activity in K562 leukemia cell line. Biochem Biophys Res Commun. 2011 Jun 17;409(4):738-44.
- Varisli L., Korkmaz-Gonen C., Tepedelen-Erbaykent B., Debelec-Butuner, Syed Muhammed H., Bogurcu N., Saatcioglu F., Korkmaz K.S., Ubiqutiously expressed HN1 down-regulates Akt mediated GSK3beta signaling, and its knockdown results with deregulated G2/M transition in prostate cells. DNA and Cell Biol. 2011 Jun;30(6):419-29
- GUR, C., AKGUN, I.H., BEDIR, E., KORKMAZ, K. S., Structure and activity relation in Alkanna. J. Nat. Prod. May 28:73(5):860-4, 2010
- Azbar, N; Dokgoz, FT; Keskin, T; Eltem R., Korkmaz KS., Gezgin Y., Akbal Z., Oncel S., Dalay MC., Gonen C., Tutuk F., Comparative Evaluation of Bio-Hydrogen Production From Cheese Whey Wastewater Under Thermophilic and Mesophilic Anaerobic Conditions. International Journal of Green Energy, 6 (2): 192-200, 2009
- Akgun I., Ganzera M., Gur C., Senol S. Korkmaz K.S., Bedir E., Determination of Naphthazarin Derivatives in 16 Alkanna Species by RP-LC Using UV and MS for Detection. Chromatographia, 70 (5-6): 963-967, 2009
- Sevimli-Gur C., Korkmaz K.S., Akgun I.H., Bedir E., Chemistry and Biological Activities of Naphthoquinones from Alkanna cappadocica Boiss.& Bal. Planta Med, 75 (9): 980-980, 2009
- Sevimli-Gur C., Bedir E., Bickici S., Korkmaz K.S., Biological activities of Turkish Alkanna species. Planta Med., 75 (9): 978-979, 2009
- HABOLD C., GALI-MUHTASIB H., KORKMAZ K.S., HARTIG R., ROESSNER A., SCHNEIDER-STOCK R. Acetylation-dependent upregulation of p21WAF1 expression after H2O2-associated DNA-damage in colorectal cancer cells. J Cell Mol Med. 12(2):607-21, 2008
- PEKIN, G., GANZERA, M., SENOL, S., BEDIR, E., KORKMAZ, K. S., STUPPNER, H. Determination of naphthazarin derivatives in endemic Turkish Alkanna species by reversed phase high performance liquid chromatography. Planta Med. 73(3), 267-72, 2007
- KORKMAZ C.G., KORKMAZ K.S., KURYS P., ELBI C., KLOKK T.I., HAMMARSTROM C., SVINDLAND A., HAGER G.L., AND SAATCIOGLU F. Molecular cloning and characterization of STAMP2, an androgen regulated six-trans-membrane protein that is overexpressed in a subset of prostate cancers. Oncogene Jul 21:24(31):4934-45, 2005
- ADAMSON E., DE BELL I., MITTAL S., WANG Y., HAYAKAWA J., KORKMAZ K., OHAGAN D., MCCLELLAND M., MERCOLA D. Egr1 signaling in prostate cancer. Cancer Biology & Therapy, 2(6):617-622, 2004
- XI Z., KLOKK T. I., KORKMAZ K.S., KURYS P., ELBI C., RISBERG B., DANIELSEN H., LODA M., SAATCIOGLU F. Kallikrein 4 Is A Nuclear Protein That Is Over-Expressed In Prostate Cancer. Cancer Res., 64(7):2365-70, 2004
- KORKMAZ C.G., KORKMAZ K.S., MANOLA J., XI Z., RISBERG B., DANIELSEN H., KUNG J., SELLERS W.R., LODA M., SAATCIOGLU F. Analysis of androgen regulated homeobox gene NKX3.1 during prostate carcinogenesis. J Urol., 172(3):1134-9, 2004
- HAYAKAWA J., MITTAL S., WANG Y., KORKMAZ K.S., ADAMSON E., ENGLISH C., OMICHI M., McCLELLAND M., MERCOLA D. Identification of promoters bound by c-Jun/ATF2 during rapid large-scale gene activation by genotoxic stress. Mol. Cell., 16 (Nov 19): 1-20,2004
- SKOTHEIM, R.I., KORKMAZ, K.S. KLOKK, T. I., ABELER, V. M., KORKMAZ, C. G., NESLAND, J. M., FOSSA, S. D., LOTHE, R. A., SAATCIOGLU, F. NKX3.1 Expression Is Lost in Testicular Germ Cell Tumors. Am J Pathol., 163: 2149-2154, 2003
- KORKMAZ K.S., ELBI C. C., KORKMAZ C. G., LODA M., HAGER G.L., SAATCIOGLU F. Molecular cloning and characterization of STAMP1, a highly prostate specific six-trans-membrane protein that is overexpressed in prostate cancer. JBC., 277(39): 36689-36696, 2002
- MATSUDA T., JUNICHO A., YAMAMOTO T., KISHI H., KORKMAZ K., SAATCIOGLU F., FUSE H., AND MURAGUCHI A. Cross-talk between Signal Transducer and Activator of Transcription 3 and Androgen Receptor signaling in Prostate Carcinoma Cells. Biochem. Biophys. Res. Com., 283:179-187, 2001
- KORKMAZ K.S., KORKMAZ C.G., PRETLOW T.G., SAATCIOGLU F., 'Distinctly different gene structure of KLK4/KLK-L1/Prostase/ARM1 compared with other members of the kallikrein family - Perinuclear localization, alternative cDNA forms and regulation by multiple hormones. DNA and Cell Biol., 20(7):435-445, 2001
- JUNICHO A., MATSUDA T., YAMAMOTO T., KISHI H., KORKMAZ K., SAATCIOGLU F., FUSE H., AND MURAGUCHI A. Protein inhibitor of activated STAT3 regulates androgen receptor signaling in prostate carcinoma cells. Biochem. Biophys. Res. Com., 278(1):9-13, 2000
- KORKMAZ K.S., KORKMAZ C.G., RAGNHILDSTVEIT E., SAATCIOGLU F., 'An efficient Procedure for Cloning Hormone Responsive Genes from a Specific Tissue.' DNA and Cell. Biol. 19(8): 499-506, 2000
- KORKMAZ K.S., KORKMAZ C.G., RAGNHILDSTVEIT E., KIZILDAG S., PRETLOW T.G., SAATCIOGLU F., 'Full-length cDNA sequence and genomic organization of human NKX3A - Alternative forms and regulation by both androgens and estrogens.' Gene 260(1): 25-36, 2000
- GURAN S., BAHCE M., BEYAN C., KORKMAZ K.S., YALCIN A. ' p53, p15INK4B, p16INK4A, and p57KIP2 mutations during the progression of chronic myeloid leukemia' Heamatologia, 29(3): 181-183, 1998
- KORKMAZ K.S., SERCAN H.O., YAZICIOGLU M.V., SAKIZLI M., BUYUKGEBIZ A.' A case with 6.7 KB Gene Deletion Associated with Isolated Growth Hormone Deficiency type 1A.', Turkish Journal of Paediatrics, Jan-March 39: 99-104, 1997.
- SERCAN H.O., KORKMAZ K.S., YAZICIOGLU M.V., SAKIZLI M., BUYUKGEBIZ A.' Two Brothers with a 7.0 KB Gene Deletion Associated with Isolated Growth Hormone Deficiency type 1A' J Pediatr Endocrinol Metab., 9 (3): 423-7, 1996
- CINGÖZ S., YÖRÜKOĞLU K., ATABEY N., KORKMAZ K. S., ÖZEN E., SAKIZLI M., ' DNA Isolation of DNA for Polymerase Chain Reaction From Formalin-fixed and Paraffin-embedded Tissues', Turkish Journal of Medical Sciences, 24 (4): 259-262, 1995
- CINGÖZ S., YÖRÜKOĞLU K., ATABEY N., KORKMAZ K. S., ÖZEN E., SAKIZLI M., 'DNA Isolation of DNA for Polymerase Chain Reaction From Formalin-fixed and Paraffin-embedded Tissues, Turkish Journal of Medical Sciences, 24 (4): 259-262, 1995.

İndekslerce Taranmayan Dergilerdeki Yayınları (3 adet)- ÇELİK Ş., KORKMAZ K.S., SARIOĞLU S., KÜPELİOĞLU A., SAKIZLI M., ' Detecting p53 exon 7 mutations of Colorectal carcinomas by Restriction Enzyme Analysis ' Turkish Journal of Cancer, 28(4): 174-8, 1998
- SARIOĞLU S., PABUÇÇUOĞLU U., KORKMAZ K.S., BİLKAY İ., AKMAN F., KUYUCUOGLU F., BASKIN H., GÜNERİ A.,“ Epstein-Barr virus infection and nasopharyngeal carcinoma” Turkish Journal of Cancer, 27(1):5-12, 1997
- TEZEL A., KORKMAZ K.S., ÇELİK Ş., SARIOĞLU S., ÖZER E., ATABEY A., SAKIZLI M., “Microsatellite Instability in Malign Melanoma and Melanocytic Nevi.” Kanser Gündemi, 2/3 July 1997

Uluslararası Toplantılarda Sunulan Bildirileri (15 adet)- 2011, Hamid, M. S., Varisli, L., Erbaykent, T. B., Debelec, B. B., and Korkmaz, K.S. ''Hoxb13 associates with cell cycle regulators, arrests cells at G1/S transition and its knockdown drives prostate cancer cells''. 4th. International Congress of Molecular Medicine, Yeditepe University, Istanbul, Turkey. 2011.
- 2011 "HN1 is a novel EGF regulated gene that is involved in AKT mediated GSK3 consequently B-catenin signaling" 4th International Congress of Molecular Medicine, Yeditepe Üniversitesi,, Istanbul- TÜRKİYE
- 2011, Varisli L., and Korkmaz K.S. " HN1 is an androgen regulated gene, negatively regulates androgen receptor signaling in prostate cancer cells" 4th International Congress of Molecular Medicine, Yeditepe University, 2011. Istanbul-Turkey.
- 2010, "Role of HN1 in Wnt signaling" Otto Von Guericke (Magdeburg) University, Magdeburg, GERMANY Davetli KONUŞMA
- 2010, HoxB13 and its role in Cancer. Oxford, UK
- 2010, Prostate inflammatory atrophy and prostate cancer. Milan, Italy
- 2010, Debelec-Butuner B., Erbaykent-Tepedelen B., Muhammed H.S., Varisli L., Bogurcu N., Korkmaz K.S., “An Inflammation Model for Studying NKX3.1 Tumor Suppressor Function in LNCaP Cells”, International Postgraduate Student Meeting on Pharmaceutical Sciences, Cesme Turkey. June 24-27 2010, Oral Presentation.
- 2009, "Role of NKX3.1 in DNA damage response" Erlangen University, Erlangen, GERMANY Davetli KONUŞMA
- 2009, HN1 and its role in prostate cancer. Copenhagen, Danmark
- 2008, "Role of NKX3.1 in DNA damage response" Athens, Greece
- 2007, "Promoter microarrays and transcriptional profiling in vivo" University of Oslo, Institute of Biological Sciences, Oslo, Norway Davetli KONUŞMA
- KORKMAZ K.S., KORKMAZ C.G., HAYAKAWA J., MITTAL S., WANG Y., ADAMSON E., McCLELLAND M., MERCOLA D. Profiling of androgen receptor regulatory transcriptional complexes in prostate cancer. 96nd American Association for Cancer Research, Anaheim, USA, 2005
- 2005, "Promoter microarrays’ Otto-Von-Guericke University, Magdeburg, GERMANY Davetli KONUŞMA
- KORKMAZ K.S., KORKMAZ C.G., PRETLOW T.G., SAATCIOGLU F., Distinctly different gene structure of KLK4/KLK-L1/Prostase/ARM1 compared with other members of the kallikrein family - Perinuclear localization, alternative cDNA forms and regulation by multiple hormones. 3rd Nuclear Receptors Meeting, Oslo, NORWAY, 2001
- KORKMAZ K.S., SERCAN H.O., YAZICIOGLU M.V., SAKIZLI M., BUYUKGEBIZ A. Isolated Growth Hormone Deficiency Type 1A Associated with 7.0 KB Gene Deletion 16th International Symposium on Growth and Growth Disorders , Lisbon, PORTUGAL. 1993.

Ulusal Toplantılarda Sunulan Bildirileri (12 adet)- Sevimli C., Şenol S., Akgun I., Caliskan O.A., Bedir E., Korkmaz K.S., 'Cytotoxic and DNA Damage Effect of Topoisomerase Inhibitors Isolated From Endemic Alkanna Species on Cancer Cells. Multidisiplinary Cancer Symposium 2008. Bursa-Uludag, TURKEY
- Erbaykent B., Korkmaz C.G., Korkmaz K.S., 'Ectopic expression of NKX3.1, restores DNA damage related H2AX phosphorylation and promote senescence in prostate cell lines. EYSF Meeting, 2008 Istanbul, Turkey
- Sevimli C., Bıçkıcı S., Nalbantoglu S., Şenol S., Gürhan I.D., Korkmaz K.S., Bedir E., 'Topoisomerase Inhibitors, Cytotoxic Activity of the Roots and Aerial Parts of Alkanna in Various Human Cancer Cell Lines. FEBS 2006. FEBS Meeting, 2006 İstanbul
- TEZEL A., KORKMAZ K.S., ÇELİK Ş., SARIOĞLU S., ÖZER E., ATABEY A., SAKIZLI M., 'Microsatellite Instability in Malign Melanoma and Melanocytic Nevi. XII. National Cancer Congress, ANTALYA, TURKEY, April, 1997 (Prof Dr. Bedii GORBON Poster Prize)
- SARIOĞLU S., PABUÇÇUOĞLU U., KORKMAZ K.S., 'Nasopharyngeal carcinoma and Epstein-Barr virus infection.XII. National Pathology Congress, ANKARA, TURKEY, Oct, 1996 (Prof Dr. Behsan ÖNOL Poster Prize)
- SARIOĞLU S., KÜPELİOĞLU A., KORKMAZ K.S., 'p53 and K-ras mutations of Colorectal Tumours XII.National Pathology Congress, ANKARA,TURKEY, Oct 1996
- SEVİL S., KORKMAZ K.S., SARIOĞLU S., KÜPELİOĞLU A., ÇELİK Ş., CEVHER B., SAKIZLI M., 'Detecting K-ras Exon 1 mutations of Colorectal Tumours by PCR-SSCP Analysis 4th National Medical Biology Congress, Dokuz Eylul University, Izmir, TURKEY, 1996
- ÇELİK Ş., KORKMAZ K.S., SARIOĞLU S., KÜPELİOĞLU A., SEVİL S., CEVHER B., SAKIZLI M., 'Detecting p53 mutations of Colorectal Tumours by SSCP and RE Analysis 4th National Medical Biology Congress, Dokuz Eylul University, Izmir, TURKEY, 1996
- SERCAN H.O., KORKMAZ K.S., YAZICIOGLU M.V., SAKIZLI M., BUYUKGEBIZ A., Isolated Growth Hormone Deficiency Type 1A Associated with 7.0 KB Gene Deletion 21st Congress of of Middle Eastern and Mediterranean Paediatric Societies , Izmir, TURKEY. 1993. (KABI Inc. Poster Prize)
- KORKMAZ K.S., SERCAN H.O., YAZICIOGLU M.V., SAKIZLI M., BUYUKGEBIZ Detection of 7.0 kb hGH1 gene deletions of both two sibs by using PCR Annual National Endocrinology Congress, Istanbul, TURKEY, 1992.
- SERCAN H.O., KORKMAZ K.S., YAZICIOGLU M.V., SAKIZLI M., BUYUKGEBIZ A., Detection of hGH1 gene deletions by using PCR 2nd National Medical Biology Congress, Hacettepe University, Ankara, TURKEY, 1992.
- KORKMAZ K.S., YAZICIOGLU M.V., SERCAN H.O., SAKIZLI M. N-myc gene amplifications in Neuroblastoma 9th National Cancer Congress and 6th Paediatric Tumors Congress, Izmir, TURKEY, 1991.

Kitapları (2 adet)- 2012, 2011, Kemal KORKMAZ, Ceren Gönen KORKMAZ “Kanserde DNA Hasarı ve Onarım Mekanizmaları” MEME KANSERİNE MOLEKÜLER VE GENETİK YAKLAŞIM, Bölüm 1: Genel Kanser Biyolojisi, Ege Üniversitesi yayınları. ISBN: 978-975-483-928-9, 2011
- 2011, Kemal KORKMAZ “DNA Hasarı ve Onarım Mekanizmaları” Dokuz Eylül Üniversitesi yayınları, Hücre Ölümü Araştırma derneği yayınları I., 2011

Tamamlanmış Araştırma Projeleri (4 adet)- 2010, Araştırma Projesi, TÜBİTAK TBAG 109S966 nolu proje raporu: NKX3.1 ve HoxB13 proteinlerinin rekombinant üretimleri ve karekterizasyonları
- 2009, Araştırma Projesi, TÜBİTAK SBAG 106S200 nolu proje raporu: Transkripsiyon faktörünün tümör baskılayıcı yeteneğinin önemi ve Prostat kanserinde hedef genlerinin araştırılması
- 2009, TÜBİTAK No:108S288, DNA damage related activation of repair and phosphorylation in prostate and mammary tumors
- 2008, Tubitak Projesi, No:105S101, Genotoksik Antikanser Ekstrelerin Elde Edilmesi, Hücresel Mekanizmalara ve Apoptoz Yolaklarına Olan Etkilerinin Araştırılması
Bilimsel Kuruluş Üyeliklerim (1 adet)- Hücre Ölümü Araştırmaları Derneği (Kurucu ve yönetim kurulu üyesi)
Kazanılan Burslar (1 adet)- 1998, TUBITAK-BilimAdami yetistirme Grubu Bursu
Kazandığı Ödüller (4 adet)- 2008, Multidisiplinary Cancer Symposium. Poster prize
- 1997, Prof. Dr. Bedii Gorbon poster prize
- 1996, Prof Dr. Behsan ÖNOL Poster Prize
- 1993, KABI Inc. poster prize 21st Pediatric Endoc. Society
Yöneterek Sonuçlandırdığı Öğrenci Tezleri (8 adet)- Doktora, 2012, NKX3.1'in DNA hasarı ve onarımındaki rolünün prostat kanseri hücrelerinde araştırılması NKX3.1 geni prostat epitelinin farklılaşmasında rol alan, özellikle hormon-bağımsız prostat kanserinin gelişiminde önemli bir tr...
- Doktora, 2012, Hücre Döngüsü kontrolünde HN1’in Rolü
- Doktora, 2011, Role of a Homebox Protein HOXB13 in DNA Damage and Repair Mechanisms and as Transcription Factor
- Doktora, 2011, NKX3.1 Transkripsiyon Faktörünün Hedef Genlerinin ve Prostat Kanseri Gelişimindeki Etkisinin Araştırılması
- Yüksek Lisans, 2010, İzole Edilen ALCAP Moleküllerinin Kanser Hücrelerinde DNA Hasarı ve Onarımına Olan Etkilerinin İncelenmesi
- Doktora, 2009, Bazı Alkanna Türlerinin Biyoaktivite Rehberli İzolasyon Yöntemi Kullanılarak Çeşitli Kanser Hücreleri Üzerindeki Sitotoksik Etkilerinin in vitro Ortamlarda Taranarak, Hücresel Mekanizmalara ve Apoptoz Yolaklarına Olan Etkilerinin Araştı...
- Yüksek Lisans, 2008, Prostat kanseri hücre hatlarında apoptoz oluşturulması ve mekanizmasının araştırılması.
- Yüksek Lisans, 2008, Prostat kanserinde NKX3.1 transkripsiyon faktörünün DNA hasarı üzerine etki mekanizmasının araştırılması